摘要:為分析感染水霉菌對(duì)巨須裂腹魚脾臟轉(zhuǎn)錄組的影響,探索水霉菌感染巨須裂腹魚的分子機(jī)制,實(shí)驗(yàn)隨機(jī)選取生活在同一水域中的5尾健康和5尾感染水霉菌的巨須裂腹魚,采用PDA瓊脂培養(yǎng)基和分子生物學(xué)方法對(duì)巨須裂腹魚水霉菌進(jìn)行分離鑒定,并采用Illumina HiSeqTM 2000高通量測(cè)序平臺(tái),對(duì)健康和感染水霉菌的巨須裂腹魚脾臟組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接、注釋和差異表達(dá)基因分析。結(jié)果顯示,從巨須裂腹魚皮膚上分離鑒定得到3株水霉菌;轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示,健康組和感染水霉病組分別獲得46 619 504條和43 912 876條數(shù)據(jù),與健康組相比,感染水霉菌組共有1 889個(gè)基因發(fā)生差異表達(dá),其中1 414個(gè)基因上調(diào),475個(gè)基因下調(diào),隨機(jī)選取6個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR (RT-qPCR)驗(yàn)證,驗(yàn)證結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序一致。對(duì)健康組和感染水霉菌組的差異表達(dá)基因進(jìn)行GO功能富集發(fā)現(xiàn),上調(diào)基因主要富集于241個(gè)功能中,下調(diào)基因主要富集于60個(gè)功能中,上述基因主要涉及分子功能類、細(xì)胞組分類和生物過(guò)程類等生理功能;KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn),差異表達(dá)基因主要富集在免疫疾病、內(nèi)分泌和代謝疾病、病毒感染性疾病、消化系統(tǒng)及排泄系統(tǒng)等。研究表明,感染水霉菌會(huì)影響巨須裂腹魚脾臟組織多種基因的表達(dá)量,實(shí)驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步探索巨須裂腹魚水霉菌的感染機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。